El Murciélago ratonero pardo (Myotis emarginatus) tiene pelos dorsales tricolores, con base gris, zona media amarillenta y puntas rojizas. Visto de cerca, es característica una profunda escotadura, casi en ángulo recto, en el borde externo de las orejas. Se refugia tanto en edificios como en cuevas. Caza principalmente arañas en el suelo y a baja altura.
Joserra Aihartza durante el trabajo de campo para su tesis doctoral "Quirópteros de Araba, Bizkaia y Gipuzkoa: distribución, ecología y conservación" localizó 20 refugios, 10 de ellos en cuevas y simas, 9 en edificios y uno en un túnel de ferrocarril abandonado. 7 de los refugios fueron colonias de cría, sumando al menos 820 adultos. En Bizkaia se ha constatado la desaparición de colonias de cría y la muerte de ejemplares como consecuencia de las obras de restauración de tejados y el tratamiento insecticida de la madera.
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